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通过小样本学习利用少量湿实验数据提升蛋白质语言模型效率

生信宝典  · 公众号  · 生物  · 2025-07-28 10:50
    

主要观点总结

本研究提出一种基于小样本学习(FSFP)的蛋白质适应度预测策略,利用元迁移学习、排序学习与参数高效微调技术,在有限标记数据下显著提升蛋白质语言模型的预测性能。该策略在87个深度突变扫描数据集上的测试表明,FSFP在无监督与监督基线模型中均具显著优势,并成功应用于改造Phi29 DNA聚合酶,提升阳性率和熔解温度。这些结果验证了FSFP在基于AI的蛋白质工程领域的应用潜力。

关键观点总结

关键观点1: FSFP策略

本研究提出一种基于小样本学习(FSFP)的蛋白质适应度预测策略,通过融合元迁移学习、排序学习与参数高效微调技术,在有限标记数据下显著提升蛋白质语言模型的预测性能。

关键观点2: FSFP优势

在87个深度突变扫描数据集上的测试表明,FSFP在无监督与监督基线模型中均具显著优势,实现了高效优化蛋白质语言模型的适应度预测。

关键观点3: 湿实验应用

FSFP成功应用于改造Phi29 DNA聚合酶,通过湿实验验证,使基于ESM-1v的预测前20位突变体的平均熔解温度与阳性率均显著提升,验证了FSFP在基于AI的蛋白质工程领域的应用潜力。


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