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微生物组-扩增子16S分析和可视化(2025.11)

生信宝典  · 公众号  · 生物  · 2025-07-19 21:00
    

主要观点总结

文章介绍了关于扩增子分析、宏基因组、转录组等领域的培训课程,包括课程大纲、教程内容简介等。文章还提到了生信基础知识和技巧、图表解读和绘制、扩增子基础和分析流程、可重复计算和统计绘图、功能预测和机器学习以及网络和环境因子分析等内容。

关键观点总结

关键观点1: 培训课程介绍

文章介绍了易生信培训团队提供的扩增子分析、宏基因组、转录组等线上线下课程,包括课程内容、培训形式、授课老师等。

关键观点2: 生信基础知识和技巧

文章阐述了生物学家在生信分析方面需要掌握的基础知识和技巧,如分析平台搭建、Linux和R基础、图表解读和绘图实战等。

关键观点3: 扩增子分析流程和内容

文章详细描述了扩增子分析的基本流程,包括实验设计、质控流程、物种注释及进化树构建等,并介绍了常用宏基因组统计作图软件STAMP和LEfSe的使用。

关键观点4: 可重复计算和统计绘图

文章强调了可重复计算的重要性,并教授如何实现R语言统计分析框架,以满足顶级文章的代码公开和网页可重复要求。

关键观点5: 功能预测和机器学习

文章介绍了功能预测工具PICRUSt和FAPROTAX的使用方法,以及机器学习分类和回归在生信分析中的应用。

关键观点6: 网络和环境因子分析

文章讲解了网络分析的基本原理和方法,包括网络绘制、多个网络比较、网络属性比较等,并介绍了环境因子分析在生信研究中的应用。


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