Cell | 解码多细胞系统：可解释语法引领虚拟生物实验革命

主要观点总结

文章介绍了一种名为“细胞行为假设语法”的新方法，该方法将细胞行为转化为数学模型，整合生物知识与多组学数据，模拟细胞在复杂微环境中的行为。文章详细描述了该语法的框架、实现方式、及其在癌症建模、脑发育模拟、免疫微环境研究、虚拟临床试验和神经发育系统建模中的应用。该方法的出现降低了生物建模的技术门槛，实现了从实验数据到虚拟模型的全流程自动化，并具备在多个场景中大规模应用的潜力。

关键观点总结

关键观点1: 细胞行为假设语法：将细胞行为转化为数学模型的系统方法

介绍了一种名为“细胞行为假设语法”的方法，允许使用自然语言描述细胞行为规则，并将其转化为数学模型。这一方法促进了生物知识与多组学数据的整合，扩展了人类对多细胞系统的理解。

关键观点2: ABM（基于代理的建模）：模拟细胞行为的工具

介绍了基于代理的建模（ABM）在模拟细胞行为中的应用。ABM将每个细胞抽象为一个智能体，模拟其在复杂微环境中的响应与变化，但面临技术门槛高和难以整合高维组学数据的挑战。

关键观点3: 细胞行为假设语法的应用：涵盖癌症建模、脑发育模拟等

详述了细胞行为假设语法在癌症建模、脑发育模拟、免疫微环境研究、虚拟临床试验和神经发育系统建模中的应用实例，展示了其降低生物建模技术门槛、提高模型生物真实性与个性化表达的能力。

关键观点4: 该方法的潜力：民主化虚拟实验工具、减少实验成本

指出细胞行为假设语法不仅革新了编程工具，更升级了生物学建模思维方式。该方法具备在数字孪生、虚拟临床试验、生物机制探索等多个场景中大规模应用的潜力，能够提前预测治疗效果、揭示潜在机制，显著减少实验成本。

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