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中山大学骆观正课题组在《Nature Communications》发文报道单分子表观转录组 m6A...

生信宝典  · 公众号  · 生物  · 2025-06-04 21:00
    

主要观点总结

中山大学骆观正课题组在单分子测序与RNA表观转录组研究领域取得重要突破,开发了基于纳米孔直接RNA测序的高精度m6A单分子检测工具SingleMod。该研究描绘了多个人类细胞系及远缘物种的m6A单分子图谱,并揭示了m6A基因组学特征与进化规律。该研究破解了RNA修饰检测的困境,为在单分子水平研究表观转录组提供了革命性的机遇。

关键观点总结

关键观点1: 研究背景及重要性

现有RNA甲基化检测方法主要基于二代测序,存在平均化问题,难以还原每一条RNA分子上修饰的真实状态。SingleMod模型的提出解决了单分子m6A检测难题,为表观转录组研究提供全新理念。

关键观点2: 技术突破与特点

本研究提出了多示例回归(MIR)算法,实现了高效利用基于NGS的绝对定量的m6A检测方法给出的位点甲基化率标签,训练了SingleMod模型。该模型可用于旧版和新版DRS数据的m6A检测。

关键观点3: 研究成果

研究使用SingleMod构建了三种人类细胞系的单分子m6A图谱,并探讨了m6A的精细定量、细胞间稳定性等特征。此外,通过对远缘物种的单分子m6A图谱的比较,揭示了三种不同的m6A分布模式。


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