Cell｜微生物负荷会干扰肠道菌群和疾病关联研究

主要观点总结

这篇文章主要介绍了宏基因组测序方法在解析不同环境复杂菌群组成和功能结构方面的应用，以及宏基因组数据与肠道微生物组和宿主生理学的关联。文章还介绍了一个预测粪便微生物负荷的机器学习模型的开发和应用，该模型揭示了微生物负荷是肠道微生物组变异的主要因素，并且与多种宿主和环境因素相关。此外，文章还探讨了微生物负荷与饮食、生活方式、药物和疾病等宿主因素之间的关联。

关键观点总结

关键观点1: 宏基因组测序的应用和肠道微生物组与宿主生理学的关联

文章利用宏基因组数据发现肠道微生物组和宿主生理学紧密相关。但宏基因组数据使用相对比例衡量微生物物种丰度会导致偏差，因此研究人员一直在探索获取绝对丰度的方法。

关键观点2: 预测粪便微生物负荷的机器学习模型的开发

研究团队建立了一个用于预测粪便微生物负荷的机器学习模型，该模型基于大规模人群粪便样本数据，发现微生物负荷是肠道微生物组变异的主要因素，也是肠道菌群-疾病关联研究中的一个关键干扰因子。

关键观点3: 微生物负荷与多种因素的关联

研究发现微生物负荷与饮食、生活方式、药物和疾病等宿主因素以及环境因素相关。具体来说，高收入国家的样本比低收入国家具有更高的微生物负荷，药物、饮食和卫生等因素会影响微生物负荷。

关键观点4: 微生物负荷与疾病之间的关联

研究还发现，某些疾病与微生物负荷显著相关。校正微生物负荷后，与疾病相关的微生物物种数量会发生变化，这表明微生物负荷可能会干扰疾病关联分析的结果。