空转 | 结合scRNA完成空转spot注释（Seurat Mapping） & 彩蛋（封面的空转...

主要观点总结

本文介绍了不结合单细胞进行空转spot的注释方式，以及使用Seurat结合单细胞转录组进行空间注释的方法。文章还涉及空转区域差异的分析和空转主图可视化的技巧。

关键观点总结

关键观点1: 空间转录组分析

介绍了使用Seurat进行空间转录组分析的过程，包括载入数据、标准分析、空间数据部分的处理等。

关键观点2: Seurat结合单细胞转录组进行空间注释

详细介绍了使用Seurat结合单细胞转录组进行空间注释的方法，包括FindTransferAnchors和TransferData等函数的用法。

关键观点3: 空转区域差异分析

介绍了如何得到每个spot的每种celltype的预测结果，并基于这些预测分数进行空转区域差异的分析。

关键观点4: 空转主图可视化

给出了空转主图可视化的几个学习点，包括外层设定统一的theme、多张图根据重要性分布、使用grid.arrange函数进行拼图等。