Nature | 美国河流微生物基因组数据库（GROWdb）

主要观点总结

本文介绍了全球环境变化背景下河流微生物研究的重要性以及美国科学家们为弥补研究缺口而创建的覆盖大部分美国水系的微生物基因组数据库（GROWdb）。该数据库集成了宏基因组学和宏转录组学数据，揭示了河流微生物的多样性、分布和功能，并为生态保护和可持续水资源管理提供了有力支持。研究成果发表在《Nature》杂志上。

关键观点总结

关键观点1: 河流微生物研究的重要性

河流作为连接陆地与海洋的重要纽带，承载着关键的生态功能。然而，与海洋微生物研究的深入相比，河流微生物的功能性研究一直处于相对薄弱的地位。

关键观点2: 关于微生物基因组数据库（GROWdb）的介绍

科学家们创建了覆盖90%美国水系的微生物基因组数据库（GROWdb），它是首个专注于河流微生物的全基因组数据库。该数据库通过整合宏基因组学和宏转录组学数据，展示了美国106个采样点的微生物种类、分布和功能。

关键观点3: 河流微生物的多样性和主要门类

数据囊括了包括放线菌门、变形菌门、拟杆菌门和疣微菌门等在内的27个门的微生物，其中一些微生物如浮游爱好菌属表现出较高的占有率和活跃的基因表达。

关键观点4: 河流微生物的功能和生态作用

大多数活跃的河流微生物具备光驱动代谢或有氧呼吸的能力，代谢路径揭示了微生物在河流生态系统中多样而高效的生存策略。此外，河流微生物展示了强大的污染物降解能力，包括抗生素抗性基因、塑料降解基因以及与氮、磷循环相关的关键基因。

关键观点5: 数据库的意义和用途

除了作为数据库，GROWdb还是一个研究平台，为理解河流生态系统的复杂性和应对环境挑战提供了新工具。它通过提供数据访问和分析工具，帮助全球研究人员共同研究河流微生物的功能和生态作用。