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R tips:ggplot2进行多维原位图绘制

生信菜鸟团  · 公众号  · 生物  · 2025-01-04 21:00
    

主要观点总结

本文介绍了如何使用ggplot2的geom_tile图层在R中绘制热图,并且展示了如何在一个热图格子中展示多维信息,如多个基因表达量、多个组别数据等。文章提供了详细的R代码示例,包括模拟数据、合并热图、绘制多维信息热图等。

关键观点总结

关键观点1: 使用R中的ggplot2包绘制热图。

介绍了使用geom_tile图层绘制热图的基本方法。

关键观点2: 模拟热图数据。

通过R代码模拟两组热图数据dat_1和dat_2。

关键观点3: 合并多个热图数据。

将两个热图数据合并到同一个热图中,通过调整热图格子的高度和位置来实现。

关键观点4: 使用position_nudge绘制多维信息的热图。

通过将数据上移或下移,实现热图格子里展示多维信息,如多个基因表达量、多个组别数据等。

关键观点5: 优化热图展示。

通过数据标准化、添加热图格子边框等方式优化热图的展示效果。


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