eggNOG-mapper简介

主要观点总结

本文介绍了eggNOG-mapper软件的功能和使用方法。该软件基于eggNOG数据库，用于对蛋白序列进行快速功能注释。流程包括选择比对方法、基于进化树数据库筛选直系同源基因、功能注释等步骤。使用说明部分介绍了输入数据格式、参数设置和结果下载方式。结果解释部分列出了注释结果中各个字段的含义。

关键观点总结

关键观点1: eggNOG-mapper软件的功能

基于eggNOG数据库，对蛋白序列进行快速功能注释，区分直系同源基因与旁系同源基因。

关键观点2: eggNOG-mapper的使用流程

包括选择比对方法、基于进化树数据库筛选直系同源基因、功能注释等步骤。

关键观点3: 使用说明

介绍了输入数据格式、参数设置（包括Taxonomic Scope、Orthology restrictions、Gene Ontology evidence等）、结果下载方式。

关键观点4: 结果解释

注释结果中包括query蛋白序列名称、seed_ortholog比对上的seed ortholog编号、evalue、score、直系同源组、COG功能分类、注释的基因功能描述等。

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