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单细胞组学 | 第25期. 单细胞亚群细分

观科研  · 公众号  ·  · 2024-06-29 19:00
    

主要观点总结

本系列文章旨在带领生信基础薄弱的科研人入门单细胞(核)转录组数据分析,本期的重点在于讲解为何要对细胞亚群进行细分以及如何完成这一过程的可视化展示。

关键观点总结

关键观点1: 为什么要对细胞亚群进行细分(Why)

对单细胞亚群进行细分可以提供更高分辨率的生物学信息,揭示细胞在正常生理和病理状态下的具体行为和功能。如异质性分析、疾病研究、细胞谱系和发育研究等。

关键观点2: 细胞亚群细分可视化有哪些常见形式(What)

细胞亚群细分可视化的常见形式包括UMAP图、气泡图等,可以通过这些图形展示细胞类型的分布和比例变化。

关键观点3: 如何完成细胞亚群细分并展示(How)

使用R语言和相应的包(如Seurat)进行数据分析和处理,包括加载数据、降维聚类分群、可视化展示等步骤。以平滑肌细胞为例,进行亚群细分并选择合适的分辨率进行可视化展示。


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