新课上线 | 单菌基因组组装、注释、遗传表征、分子分型、系统进化和传播溯源

主要观点总结

该文章介绍了易生信培训团队开设的单菌基因组相关的线上线下课程，包括扩增子16S分析、宏基因组、单物种转录组、单菌基因组等内容。课程旨在利用全基因组测序(WGS)数据，对属于单个微生物物种的特征菌株或病原体毒株基因组进行研究，包括基因组组装、基因注释、遗传表征、分子分型、系统进化和传播溯源等。

关键观点总结

关键观点1: 课程内容与目标

课程围绕细菌、病毒或真菌基因组的第二/三代测序数据，完成基因组组装、基因注释、遗传表征、分子分型、系统进化和传播溯源。课程的测试数据来自细菌，但分析框架也适用于病毒、真菌和原生生物。课程旨在帮助研究人员建立系统的基因组分析流程，培养相关生信人才。

关键观点2: 适用人群

课程适用于微生物学、进化生物学、传染病/流行病学、临床微生物检验、公共卫生领域的相关学生或研究人员。

关键观点3: 课程资源与模式

课程提供计算平台、课件、流程代码、生信软件、配套数据库、课程直播、视频回看和答疑群等资源。直播与回放结合，流程与代码配合，帮助学员快速部署流程，熟悉操作方法，强化编程技能，完善理论学习，提升专业技能。

关键观点4: 课程安排与特色

课程包括课前准备工作和正式课程。正式课程涵盖基因组组装、注释、遗传表征、分子分型、系统进化和传播溯源的各个方面。每节课1小时一个主题，理论结合实战，学员可学懂原理并进行实战操作。