自适应通路分析

主要观点总结

文章主要介绍了关于肿瘤研究的进展，特别是针对MKI67基因在肿瘤组织中的分析。内容包括对MKI67与其他基因的相关性分析、GSEA富集分析、通路评分和与MKI67的相关性等。

关键观点总结

关键观点1: 已经完成单基因单肿瘤的研究，以MKI67为例。

文章已经完成了对单基因单肿瘤的研究，特别是以MKI67为例，进行了深入的分析。

关键观点2: 待完善多基因单肿瘤、多基因多肿瘤、单基因多肿瘤的研究。

文章指出，目前还需要进一步完善多基因单肿瘤、多基因多肿瘤以及单基因多肿瘤的研究。

关键观点3: 执行MKI67在肿瘤组织中的相关性分析和GSEA富集分析。

文章通过clusterprofiler包执行了MKI67在肿瘤组织中的相关性分析和KEGG基因集的GSEA富集分析。

关键观点4: 评估通路评分与MKI67的相关性。

文章采用了gsva包的zscore参数评估通路评分，并计算了与MKI67的的相关性。此外，还基于TCPA RPPA蛋白数据和easier包评估了其他通路的评分。

关键观点5: 追求提升用户体验，简化操作。

文章强调将继续以缩减按钮、追求一个按钮即组一张大图为目标，以增加用户体验为重要方向。