用数据库轻松预测分子之间相互作用，19个常用数据库盘点！

主要观点总结

本文整理了五类分子互作常用的预测数据库，包括蛋白-蛋白、RNA-蛋白、RNA-RNA/DNA以及化合物-蛋白的相互作用数据库。

关键观点总结

关键观点1: 蛋白-蛋白相互作用数据库

包括STRING、IID、BioGRID和HPRD等数据库，通过形成复合物或直接影响效应蛋白的功能来发挥作用。这些数据库提供了蛋白互作的详细信息，包括物种、相互作用类型、实验证据等。

关键观点2: RNA-蛋白相互作用数据库

包括atRAPID、RBPDB、RPISeq和RNAct等工具，用于预测RNA与蛋白的相互作用。这些工具基于RNA和蛋白的结构特性和结合能力进行预测，对于研究RNA结合蛋白的功能和机制非常重要。

关键观点3: RNA-RNA/DNA相互作用数据库

包括StarBase和TargetScan等网站，用于预测miRNA与靶基因的结合以及RNA与DNA的碱基互补配对。这些网站提供了丰富的数据资源和可视化界面，有助于研究基因表达和调控机制。

关键观点4: 化合物-蛋白相互作用数据库

包括STITCH、TCMSP、TTD和ChEMBL等平台，用于探索化合物与蛋白之间的相互作用关系。这些平台集成了实验验证的数据和计算预测的结果，为药物研发、系统生物学研究和网络药物发现提供了重要资源。

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