Nat Struct Mol Biol丨任兵/胡明/于淼团队揭示小鼠胎儿发育过程中转录调控相关染色质...

主要观点总结

本文介绍了在小鼠胎儿发育过程中基因表达的谱系特异性和发育阶段特异性的调控机制，特别是染色质远程互作在其中的重要作用。研究团队使用H3K4me3 PLAC-seq技术绘制了小鼠胎儿多组织多阶段染色质远程三维互作图谱，并识别了增强子靶基因，揭示了小鼠胎儿发育的转录调控机制。此外，该研究还发现了小鼠胎儿组学数据在人类疾病研究中的潜力。

关键观点总结

关键观点1: 研究背景及重要性

了解小鼠胎儿发育过程中的基因表达调控对于理解人类胎儿发育和疾病发生机制具有重要意义。

关键观点2: 核心技术

研究团队使用H3K4me3 PLAC-seq技术绘制了小鼠胎儿多组织多阶段染色质远程三维互作图谱，这是一种靶向高通量染色质构象捕获测序技术，适用于研究特定蛋白介导的染色质远程互作。

关键观点3: 主要成果

研究团队检测到了248,620个以启动子为中心的染色质远程互作对，涉及14,138个蛋白编码基因。这些互作显著富集在启动子与增强子元件间，揭示了启动子参与的染色质远程互作在小鼠胎儿发育过程中的重要性和动态变化。

关键观点4: 增强子识别与疾病关联

研究团队从已注释的发育相关候选CRE中识别了15,098个候选增强子（cEnhancer），并发现这些区域内富集多种疾病风险相关的非编码遗传变异，证明了小鼠胎儿组学数据在人类疾病研究中的巨大应用潜力。

关键观点5: 研究意义

本研究加深了对小鼠胎儿发育转录调控机制的理解，并为人类疾病研究提供了宝贵的参考数据。

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